威灵仙是一种常用的中药材，但使用时也可能存在一些副作用。一般来说，少数人服用威灵仙后可能会出现消化道不适，比如约有2% - 5%的人可能会出现恶心、呕吐、胃痛等症状。
胃肠道方面的副作用
胃肠刺激表现：部分人服用威灵仙后会出现不同程度的胃肠刺激症状。轻者可能只是感觉胃部稍有不适，有胀满感；重者可能出现较为明显的恶心，甚至频繁呕吐，有的还会出现腹痛、腹泻等情况。比如在一些临床观察中发现，约有3% - 7%的人在服用常规剂量威灵仙后会出现不同程度的胃肠道不适反应。个体差异影响：每个人对威灵仙的耐受程度不同，有些人本身胃肠道功能较弱，服用后出现胃肠道副作用的概率相对更高。比如本身有慢性胃炎、胃溃疡等基础胃肠道疾病的人群，服用威灵仙后更容易出现胃肠道不适症状。
过敏相关副作用
过敏症状表现：少数人可能对威灵仙过敏，过敏反应轻的可能出现皮肤瘙痒、皮疹等情况，皮肤会出现红斑、丘疹等；严重的可能出现过敏性休克，表现为呼吸困难、面色苍白、血压下降等。不过过敏反应相对较为少见，大约发生率在0.1% - 0.3%左右，但一旦发生后果较为严重。过敏人群特点：有过敏体质的人相对更容易出现威灵仙过敏反应。过敏体质的人往往对多种物质容易产生过敏，在接触威灵仙后，免疫系统会错误地将其识别为外来的有害物质，从而引发过敏反应。
其他可能的副作用
神经系统影响：极少数人服用威灵仙后可能会出现头晕、头痛等神经系统方面的症状。不过这种情况发生的概率非常低，大约在0.05%以下。一般来说，头晕可能表现为轻度的头重脚轻感，头痛多为隐痛或胀痛；对肝肾功能的潜在影响：目前虽然大规模的临床研究显示常规剂量服用威灵仙对肝肾功能影响不大，但超剂量或长期服用时，可能会对肝肾功能有一定潜在影响。不过正常按照药典规定的剂量和疗程使用，这种风险极低。比如按照中医常规的3 - 10克左右的常用剂量短期使用，对肝肾功能的影响可以忽略不计，但如果过量服用，如超过30克连续服用数月，就可能会增加肝肾功能损伤的风险。