念珠菌阴道炎主要通过抗真菌药物治疗，一般7天左右为一个疗程。常见的治疗药物有克霉唑制剂、咪康唑制剂等。
药物治疗选择
克霉唑制剂： 有克霉唑栓，每晚1粒（150mg），连用7日；或每日早、晚各1粒（100mg），连用3日。咪康唑制剂： 咪康唑栓，每晚1粒（200mg），连用7日；或每晚1粒（400mg），连用3日；还可以用2%的咪康唑乳膏，早晚各一次，连用7日。
生活方式调整
保持外阴清洁干燥： 每天用温水清洗外阴，要注意单独清洗，避免交叉感染。清洗后要保持外阴部干燥，尽量不穿紧身化纤内裤，选择棉质宽松的内裤。避免滥用抗生素： 长期大量使用抗生素会抑制阴道内乳酸杆菌的生长，破坏阴道的正常微生态环境，从而容易引发念珠菌阴道炎。所以要避免不必要的抗生素使用。
特殊人群注意事项
孕妇： 孕妇患念珠菌阴道炎需谨慎用药，以局部用药为主，不建议口服抗真菌药物。可选择对胎儿影响较小的克霉唑制剂等局部用药，用药需在医生指导下进行。糖尿病患者： 糖尿病患者由于血糖控制不佳时，阴道内糖原含量升高，适合念珠菌生长繁殖，容易反复发生念珠菌阴道炎。这类患者除了积极治疗阴道炎外，还需要严格控制血糖，将血糖控制在合理范围内，才能更好地治疗阴道炎并预防复发。