甲状腺炎引起的原因较为复杂，不同类型的甲状腺炎诱因有所不同。比如自身免疫性甲状腺炎，约有5% - 15%的女性在产后会发生产后甲状腺炎，这与自身免疫相关。
自身免疫因素导致的甲状腺炎
桥本甲状腺炎： 它是最常见的自身免疫性甲状腺炎，遗传因素在其中起一定作用，如果家族中有亲属患桥本甲状腺炎，其他人患病风险会相对增加。自身免疫系统错误地攻击甲状腺组织，使得甲状腺细胞受损，从而引发炎症。产后甲状腺炎： 主要发生在产后1年内，与产后身体免疫状态的变化有关。怀孕时母体免疫处于一种特殊状态，产后这种平衡被打破，免疫系统开始攻击甲状腺，导致甲状腺炎的发生。
病毒感染相关的甲状腺炎
亚急性甲状腺炎： 常常继发于上呼吸道感染之后，比如在感染流感病毒、柯萨奇病毒等病毒后，病毒会影响甲状腺，引发甲状腺的炎症反应。患者会出现甲状腺部位疼痛、发热等症状，血液中炎症指标会升高。
辐射因素引起的甲状腺炎
放射性损伤： 颈部接受过放射性治疗，像头颈部恶性肿瘤进行放射性碘治疗等，射线会损伤甲状腺组织，导致甲状腺炎的发生。长时间处于高辐射环境中，也可能增加患甲状腺炎的风险。例如，在核事故等情况下，暴露于放射性物质周围的人群，甲状腺炎的发生率会有所上升。