做肠镜可能存在以下危害：肠黏膜损伤、交叉感染以及肠穿孔。
一、肠黏膜损伤：肠镜检查主要用于观测结肠和大肠内部状况，以判断有无病变。进行肠镜检查时需将内镜置入肠道，在此过程中若操作不当，就容易导致肠黏膜受损，检查结束后可能会出现腹部疼痛的情况。
二、交叉感染：若在做肠镜检查时消毒环节不达标，就有引发交叉感染的可能。
三、肠穿孔：当存在肠道溃疡现象时，如果检查操作不当，会加大肠穿孔的风险。
总之，虽然肠镜检查在诊断肠道疾病方面有重要作用，但也可能带来这些潜在的危害，在进行检查时应选择正规医疗机构并由专业人员操作，以尽量减少风险。