肾积水是由于尿路梗阻导致尿液从肾脏排出受阻，从而引起肾盂肾盏扩张。引起肾积水的原因有多种，其中最为常见的是尿路结石，大约有50%左右的肾积水是由尿路结石引起的。
一、泌尿系统自身病变引起
1. 肾盂输尿管连接部狭窄： 这是先天性的一种情况，多是由于局部的肌肉结构异常等原因导致，从胚胎发育时期就可能存在结构上的缺陷，使得肾盂和输尿管连接的部位狭窄，尿液通过受阻，进而引发肾积水。这种情况在儿童中相对多见。2. 输尿管病变： 比如输尿管肿瘤，肿瘤生长会堵塞输尿管，影响尿液的正常输送；还有输尿管炎症引起的狭窄，炎症导致输尿管管壁增厚、管腔变窄，尿液排出不畅，长期就会造成肾积水。
二、外部病变压迫所致
1. 盆腔肿瘤： 像子宫肌瘤、卵巢癌等盆腔内的肿瘤，随着肿瘤的逐渐增大，可能会压迫到输尿管，使得输尿管的通畅性受到影响，尿液排出受阻，进而引起肾积水。尤其是肿瘤生长到一定大小，对周围组织产生压迫时更容易出现这种情况。2. 腹膜后纤维化： 这是一种自身免疫性相关的疾病，腹膜后组织发生纤维化病变，会包裹、压迫输尿管，导致输尿管狭窄，尿液排出困难，引发肾积水。这种情况相对比较隐匿，早期可能症状不明显。
三、下尿路病变引发
1. 前列腺增生： 在中老年男性中较为常见，前列腺增生会导致尿道狭窄，膀胱出口梗阻，尿液排出不畅，尿液会反流至输尿管、肾脏，从而引起肾积水。据统计，50岁以上的男性中约有一半患有前列腺增生相关的下尿路症状，其中部分会发展为肾积水。2. 尿道狭窄： 多是由于尿道外伤、炎症等原因造成尿道管腔变窄，尿液排出受阻，进而影响到上尿路，导致肾积水。比如有过尿道器械检查损伤或者尿道感染病史的患者，容易出现尿道狭窄的情况。