肠系膜淋巴结炎多由病毒感染引起，一般可使用对症治疗的药物。对于因病毒感染导致的肠系膜淋巴结炎，若有发热等症状，可使用布洛芬等退热药物，通常能在一定时间内缓解症状，比如布洛芬一般能在0.5~1小时左右开始发挥退热作用。
对症治疗药物
退热药物： 当患儿体温超过38.5℃时，可使用对乙酰氨基酚来退热，它适用于3个月以上的儿童等人群，能通过抑制前列腺素合成发挥退热作用。抗病毒药物： 若考虑是病毒感染且病情需要，可使用利巴韦林等抗病毒药物，但利巴韦林对孕妇和自身免疫性肝炎患者等有禁忌，需医生评估后使用。
抗生素使用情况
一般不常规使用： 肠系膜淋巴结炎大多是病毒感染所致，所以一般不常规使用抗生素。但如果合并细菌感染，如出现化脓性淋巴结炎等情况，才会根据药敏结果选用合适抗生素，像头孢菌素类抗生素，不过要先排除患儿对头孢类药物过敏等情况。
针对腹痛的药物
解痉药物： 若患儿有明显腹痛症状，可使用山莨菪碱来缓解平滑肌痉挛，减轻腹痛，但2岁以下儿童使用需谨慎，要在医生指导下评估后应用。中成药辅助： 一些清热解毒的中成药也可辅助治疗，比如小儿豉翘清热颗粒等，有一定缓解淋巴结炎相关症状的作用，但使用时要注意药物成分是否会与其他药物发生相互作用等情况。需要注意的是，药物的使用都要在医生的诊断和指导下进行，家长不要自行给患儿用药，要根据患儿具体病情，严格遵循医生的建议来选择合适的药物治疗肠系膜淋巴结炎。