直肠炎的药物治疗有多种，常用的有氨基水杨酸制剂，像柳氮磺吡啶，它能抑制炎症反应，一般用于轻、中度直肠炎的治疗。
氨基水杨酸制剂类
柳氮磺吡啶： 是常用的氨基水杨酸制剂，通过在肠道内分解为磺胺吡啶和5 - 氨基水杨酸，5 - 氨基水杨酸可抑制前列腺素合成，从而减轻炎症反应，适用于轻、中度直肠炎患者。美沙拉嗪： 也是氨基水杨酸制剂，有口服剂型和栓剂、灌肠剂等局部剂型。局部剂型可直接作用于直肠部位，更针对性地缓解直肠炎症，对于直肠炎局部症状的改善效果较好。
糖皮质激素
氢化可的松栓剂： 属于局部用糖皮质激素，可直接作用于直肠黏膜，减轻炎症水肿等症状，适用于氨基水杨酸制剂疗效不佳的轻、中度直肠炎患者。但长期使用可能会有一些副作用，如局部刺激等，需要在医生指导下使用。布地奈德灌肠剂： 同样是局部糖皮质激素，能有效减轻直肠炎症，且全身副作用相对较小，对于直肠炎的炎症控制有一定作用，但也需遵循医生的用药安排。
免疫抑制剂
硫唑嘌呤： 对于一些重度且对糖皮质激素治疗效果不佳的直肠炎患者，可能会使用免疫抑制剂，硫唑嘌呤通过抑制免疫反应来发挥作用，但起效相对较慢，且可能会有一些不良反应，如骨髓抑制等，用药过程中需要密切监测血常规等指标。巯嘌呤： 也是免疫抑制剂的一种，作用机制与硫唑嘌呤类似，在直肠炎的治疗中，对于一些特殊情况的患者会考虑使用，但使用时要严格评估患者的病情和身体状况。