小肚子下面两边痛可能由多种原因引起。比如女性常见的妇科问题，像附件炎，育龄女性较为多发，通常会伴有白带异常等表现；而泌尿系统结石也可能导致这种疼痛，比如输尿管结石，疼痛可能比较剧烈，还可能伴有血尿等症状。
妇科方面的原因
盆腔炎： 多发生在性活跃的生育期女性，通常是由细菌感染引起，可出现小肚子下面两边持续或间断的疼痛，还可能伴有发热、阴道分泌物增多等情况。子宫内膜异位症： 多见于30 - 40岁的女性，异位的内膜组织会导致盆腔粘连等，引起小肚子下面两边疼痛，且常在月经期间加重，部分患者可能会影响生育。
泌尿系统方面的原因
输尿管结石： 当结石在输尿管移动时，会引起小肚子下面两边的剧烈疼痛，疼痛呈绞痛性质，还可能伴有恶心、呕吐，疼痛发作时可能会出现肉眼可见的血尿或者镜下血尿。膀胱炎： 女性发病率相对较高，主要是细菌感染所致，除了小肚子下面两边痛，还可能有尿频、尿急、尿痛等症状，排尿时尿道有灼热感。
肠道方面的原因
乙状结肠炎症： 多由细菌感染或者饮食不当引起，可出现小肚子下面两边隐痛，可能伴有腹泻、腹胀等症状，腹泻程度轻重不一，严重时可能影响营养吸收。结肠痉挛： 可能与腹部受凉、进食刺激性食物等有关，会出现阵发性的小肚子下面两边疼痛，疼痛缓解时腹部可无异常表现，发作时可能会有肠鸣音亢进。