脑干脑梗塞的治疗方法主要包括以下几个方面：
1.一般治疗：患者需要卧床休息，保持呼吸道通畅，吸氧，加强护理，防止肺炎、肺栓塞、泌尿系感染等并发症的发生。
2.药物治疗：
溶栓治疗：重组组织型纤溶酶原激活剂（rt-PA）是目前我国唯一批准上市的溶栓药物，可显著降低脑梗死患者的死亡率和残疾率，改善预后。发病4.5小时内的患者，或虽超过4.5小时但经评估仍可溶栓的患者，可采用静脉溶栓治疗。
抗血小板治疗：常用药物有阿司匹林、氯吡格雷等。阿司匹林可以抑制血小板聚集，预防血栓形成；氯吡格雷作用机制与阿司匹林相似，但作用更强。
抗凝治疗：对于有高凝状态、心房颤动等血栓形成高危因素的患者，可使用抗凝药物，如华法林、利伐沙班等。抗凝治疗可降低脑梗死的复发风险，但出血风险相对较高。
神经保护治疗：常用药物有依达拉奉、胞磷胆碱、脑蛋白水解物等。这些药物可以清除自由基，保护神经元，促进神经功能恢复。
其他药物：根据患者的具体情况，还可使用改善循环、调控血压、血糖等药物。
3.手术治疗：
颈动脉内膜切除术：适用于颈动脉狭窄程度大于70%的患者，通过切除增厚的颈动脉内膜，预防脑梗死的发生。
血管内介入治疗：对于大动脉粥样硬化性脑梗死患者，在有条件的情况下，可进行血管内介入治疗，如血管内溶栓、球囊扩张成形术、支架置入术等。
4.康复治疗：脑梗死患者在病情稳定后，应尽早进行康复治疗，包括物理治疗、作业治疗、言语治疗、吞咽功能训练等，以促进患者的康复，提高生活质量。
需要注意的是，脑干脑梗塞的治疗方法应根据患者的具体情况制定个体化的方案，包括病因、病情严重程度、并发症等因素。患者应在医生的指导下进行治疗，并积极配合康复训练，以提高治疗效果。