舌下两侧有小肉芽可能是正常的生理结构，也可能是由疾病引起的。以下是一些可能的原因：
1.舌下肉阜：这是舌下黏膜正常的生理结构，位于舌下两侧，呈对称性分布，是唾液腺导管的开口。
2.口腔炎症：如口腔溃疡、牙龈炎等，可能导致舌下黏膜充血、肿胀，出现肉芽样改变。
3.乳头状瘤：是一种良性肿瘤，通常由病毒感染引起，可发生在口腔黏膜的任何部位，包括舌下。
4.口腔尖锐湿疣：这是一种由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起的性传播疾病，可发生在口腔黏膜，表现为舌下肉芽样赘生物。
5.恶性肿瘤：舌下腺样囊性癌、鳞状细胞癌等恶性肿瘤也可导致舌下出现肿物。
如果发现舌下有小肉芽，建议及时就医，进行详细的口腔检查和相关的实验室检查，以明确病因。医生可能会根据具体情况采取不同的治疗方法，如药物治疗、手术治疗、物理治疗等。
此外，保持良好的口腔卫生习惯，避免吸烟、饮酒等不良嗜好，有助于预防口腔疾病的发生。如果有性伴侣，应注意避免不洁性行为，以预防性传播疾病的发生。