引起两岁宝宝发烧时头部不热但身上热的原因有很多，以下是一些常见的原因：
1.穿盖过多：如果宝宝穿衣或盖被过厚，会导致身体热量无法散发，从而使身上发热，而头部因为暴露在外面，热量容易散发，所以温度相对较低。
2.感染：宝宝感染细菌、病毒或其他病原体时，可能会出现发烧的症状。感染部位不同，发热的表现也会有所差异。例如，呼吸道感染时，宝宝可能会出现咳嗽、流鼻涕等症状，而消化道感染时，宝宝可能会出现呕吐、腹泻等症状。
3.免疫系统发育不完善：两岁宝宝的免疫系统尚未完全发育成熟，容易受到感染和炎症的影响。当宝宝感染病毒或细菌时，免疫系统会产生反应，导致体温升高。
4.环境因素：如果宝宝所处的环境温度过高或过低，也会影响体温的调节。例如，在炎热的夏天，宝宝可能会因为过热而出现发烧的症状；在寒冷的冬天，宝宝可能会因为保暖不足而出现体温过低的情况。
5.其他原因：某些疾病也可能导致宝宝发烧时头部不热但身上热，如幼年特发性关节炎、川崎病等。
如果宝宝发烧时头部不热但身上热，家长可以采取以下措施：
1.测量体温：使用体温计测量宝宝的体温，以确定发烧的程度。
2.松解衣物：适当减少宝宝的衣物，以帮助散热。
3.保持环境适宜：保持宝宝所处环境的温度适宜，避免过热或过冷。
4.多喝水：鼓励宝宝多喝水，以补充水分，防止脱水。
5.观察症状：密切观察宝宝的症状，如是否出现咳嗽、流鼻涕、呕吐、腹泻等症状。如果症状持续或加重，应及时就医。
6.就医：如果宝宝的体温超过38.5℃，或出现精神萎靡、呼吸急促等异常症状，应及时就医。医生会根据宝宝的具体情况进行诊断，并给予相应的治疗。
需要注意的是，以上内容仅供参考。如果家长对宝宝的病情有任何疑问或担忧，应及时咨询医生，以获得专业的建议和治疗。