阴茎根部里面隐隐作痛可能与多种原因有关，以下是一些可能的原因：
1.前列腺炎：前列腺位于阴茎根部深处，前列腺炎可能导致疼痛放射至阴茎根部。此外，还可能伴有尿频、尿急、尿痛等症状。
2.前列腺增生：前列腺增生是老年男性常见的疾病，可能导致排尿困难、尿不尽等症状，也可能引起阴茎根部疼痛。
3.尿道炎：尿道炎是尿道的炎症，可引起尿道口红肿、尿痛，炎症可能波及阴茎根部，导致疼痛。
4.附睾炎：附睾炎是附睾的炎症，常伴有阴囊疼痛，疼痛可放射至阴茎根部。
5.精索静脉曲张：精索静脉曲张是精索内蔓状静脉丛的异常扩张、伸长和迂曲，可导致阴囊内坠胀不适，有时可累及阴茎根部，引起疼痛。
6.阴茎硬结症：阴茎海绵体白膜的纤维化病变，可使阴茎勃起时出现疼痛，阴茎根部也可能有疼痛。
7.其他原因：阴茎根部的损伤、感染、肿瘤等也可能引起疼痛。
需要注意的是，这些只是一些可能的原因，具体情况需要通过详细的病史采集、体格检查和必要的辅助检查来确定。如果阴茎根部疼痛持续不缓解或伴有其他症状，如血尿、性功能障碍等，应及时就医，以便明确诊断并采取适当的治疗措施。
对于特殊人群，如老年人、有性传播疾病风险的人群等，医生可能会进行更详细的评估和检查，以排除其他潜在的疾病。此外，保持良好的生活习惯，如规律的性生活、避免久坐、注意个人卫生等，有助于预防阴茎根部疼痛的发生。
总之，阴茎根部里面隐隐作痛可能是多种疾病的表现，需要及时就医，以便明确诊断并进行针对性治疗。在就医过程中，应如实告知医生症状的特点、持续时间以及其他相关信息，以便医生做出准确的诊断和提供合适的治疗建议。