阴茎根部里面隐隐作痛可能由多种原因引起，以下是一些可能的原因和建议：
1.前列腺炎：前列腺位于阴茎根部深处，前列腺炎可能导致疼痛。除了疼痛，还可能伴有尿频、尿急、尿痛等症状。建议及时就医，进行前列腺液检查和其他相关检查，以明确诊断。治疗方法包括药物治疗、物理治疗等。
2.附睾炎或睾丸炎：附睾和睾丸位于阴茎根部附近，炎症可引起疼痛。还可能伴有阴囊红肿、发热等症状。需要就医，进行阴囊超声等检查，以确定病因。治疗通常包括使用抗生素。
3.精索静脉曲张：精索内的静脉扩张和迂曲，可能导致阴茎根部疼痛。疼痛可能在站立或劳累后加重，平卧或休息时缓解。医生通过触诊和超声检查可以确诊。严重的精索静脉曲张可能需要手术治疗。
4.阴茎硬结症：阴茎海绵体的纤维化或硬结形成，可引起疼痛和勃起功能障碍。这种情况通常需要进一步检查，如阴茎超声或磁共振成像（MRI）。治疗方法包括药物治疗、物理治疗或手术治疗，具体取决于病情的严重程度。
5.其他原因：阴茎根部疼痛还可能与外伤、感染、结石、肿瘤等因素有关。
对于阴茎根部里面隐隐作痛的情况，建议及时就医，进行详细的身体检查和相关检查，以确定病因。医生会根据具体情况制定相应的治疗方案。在等待就医期间，应注意休息，避免过度劳累和长时间坐着。同时，避免性行为和刺激，保持阴茎清洁。
需要注意的是，以上信息仅供参考，具体情况可能因个体差异而有所不同。如果疼痛持续不缓解或加重，应尽快就医。此外，对于某些特殊人群，如老年人、糖尿病患者、免疫功能低下者等，阴茎根部疼痛可能与更严重的疾病有关，如前列腺癌等，因此更应及时就医进行全面检查。