捐献骨髓一般不会对身体造成长期显著副作用。目前常用的造血干细胞捐献方式是外周血造血干细胞采集，过程相对安全。
短期可能的轻微反应
采集外周血造血干细胞时，个别人可能出现轻微不适，如穿刺部位疼痛、短暂的头晕等，这些多能在短时间内缓解。
对造血功能的影响
正常情况下，人体骨髓造血储备丰富，捐献造血干细胞后，骨髓会加速造血，一般1 - 2周内血液中的各种血细胞就能恢复到原来水平，不会影响正常造血功能。
对身体整体健康的影响
绝大多数人捐献后身体可良好恢复，对日常生活、工作等基本无长期不良影响。但对于一些特殊人群，如本身有血液系统基础疾病或体质较弱者，需在捐献前经严格评估，确保安全。
特殊人群的情况
对于儿童，由于身体各方面发育尚不完善，若要捐献骨髓需更谨慎评估；对于女性，一般不影响正常的月经、生育等生理功能，但也需在合适的健康状态下进行捐献评估；有基础病史的人群，如心脏病、糖尿病等，要经专业医生全面评估能否耐受捐献过程。