N95口罩和医用外科口罩的主要区别在于过滤效率和适用场景。N95口罩对非油性颗粒物的过滤效率大于等于95%，主要用于防护各类颗粒物，包括粉尘、烟、雾和微生物等，同时也可以用于防护微生物，如病毒和细菌。而医用外科口罩对细菌的过滤效率大于等于95%，主要用于临床医务人员在有创操作过程中佩戴，覆盖住使用者的口、鼻及下颌，防止血液、体液和飞溅物的传播，对细菌的过滤效率较高，但对颗粒物的过滤效率有限。
此外，N95口罩的防护级别更高，价格也相对较贵。在一般情况下，如果只是日常防护，选择医用外科口罩即可；如果需要在高风险环境中工作，或者接触疑似病例，建议选择N95口罩。同时，无论是佩戴N95口罩还是医用外科口罩，都需要正确的佩戴方法和注意事项，如保持口罩的清洁、避免触摸口罩的外部、定期更换口罩等，以确保防护效果。