小孩长牙发烧39°C，可采取以下治疗方法：
1.物理降温：用温水擦拭手心、腋窝、腹股沟等部位，或使用退热贴。
2.药物治疗：可口服布洛芬或对乙酰氨基酚等退烧药，具体剂量根据体重和年龄计算。同时，应注意给孩子多喝水，以补充水分，防止脱水。
3.观察病情：密切观察孩子的体温、精神状态、饮食等情况，如有异常，及时就医。
4.就医治疗：如果孩子发烧持续不退，或出现高热惊厥、呼吸急促等症状，应立即就医，进行进一步的检查和治疗。
5.注意口腔卫生：在孩子长牙期间，要注意保持口腔清洁，可使用纱布或指套牙刷轻轻擦拭牙龈。
6.避免感染：避免带孩子去人员密集的场所，注意室内通风，勤洗手，避免交叉感染。
7.饮食调整：孩子发烧时，饮食以清淡易消化为主，可适当增加水分和维生素的摄入。
需要注意的是，以上治疗方法仅供参考，如果孩子症状持续不缓解或出现其他异常，应及时就医，以免延误病情。同时，在孩子长牙期间，要注意观察孩子的情绪和行为变化，给予适当的安抚和照顾。