小孩阴茎短小的主要原因有以下几点：
1.遗传因素：阴茎的大小与遗传因素密切相关。如果家族中有阴茎短小的成员，那么小孩出现阴茎短小的几率可能会增加。
2.发育问题：在胎儿时期，阴茎的发育受到多种因素的影响，如激素水平、营养状况等。如果胎儿发育过程中出现问题，可能会导致阴茎短小。
3.疾病因素：一些疾病也可能影响阴茎的发育，如先天性肾上腺皮质增生症、睾酮缺乏症等。这些疾病会导致激素水平异常，从而影响阴茎的正常发育。
4.肥胖：肥胖儿童体内脂肪较多，会使阴茎根部被脂肪组织掩盖，从而显得阴茎短小。
5.其他因素：如外伤、手术等也可能影响阴茎的发育。
需要注意的是，小孩的阴茎大小会随着年龄的增长而发生变化，在青春期前，阴茎的发育相对较慢，青春期后会迅速发育。如果家长对小孩的阴茎大小存在疑虑，建议及时咨询医生，进行详细的检查和评估。医生会根据具体情况给出相应的建议和治疗方案。同时，家长也应该注意小孩的营养均衡、健康生活方式等，以促进其身体的正常发育。