两种药物的主要区别如下：
1.降脂机制：阿托伐他汀钙片和瑞舒伐他汀钙片都是他汀类药物，主要通过抑制胆固醇合成限速酶HMG-CoA还原酶，减少胆固醇合成，从而降低血液中LDL-C水平。但它们的作用机制略有不同。
2.药代动力学：阿托伐他汀钙片和瑞舒伐他汀钙片的药代动力学特性也有所不同。例如，瑞舒伐他汀钙片的口服吸收率较高，生物利用度较高，且血浆半衰期较长，因此作用时间相对较长。
3.适用人群：虽然两种药物都可用于治疗高胆固醇血症和心血管疾病，但在某些情况下，医生可能会根据患者的具体情况选择不同的药物。例如，瑞舒伐他汀钙片的起始剂量较低，适用人群更广。
4.不良反应：阿托伐他汀钙片和瑞舒伐他汀钙片的不良反应相似，但在某些方面也有所不同。例如，瑞舒伐他汀钙片引起肌肉损伤的风险相对较低。
5.药物相互作用：阿托伐他汀钙片和瑞舒伐他汀钙片与其他药物的相互作用也有所不同。在使用这两种药物时，需要注意与其他药物的相互作用，避免不良反应的发生。
需要注意的是，以上信息仅供参考，具体用药应在医生的指导下进行。