月经最后两天有褐色分泌物，可能是以下原因引起：
1.黄体功能萎缩不全：黄体功能萎缩不全可能导致子宫内膜不规则脱落，使月经后期出血量少，分泌物呈现褐色。此外，还可能伴有月经周期缩短、经期延长等症状。
2.子宫内膜息肉：子宫内膜息肉是一种常见的妇科疾病，可能导致月经间期出血、经量增多、经期延长或月经淋漓不尽，表现为月经最后两天有褐色分泌物。
3.子宫内膜炎：子宫内膜炎是子宫内膜的炎症，可能导致子宫内膜充血、水肿，分泌物增多，出现褐色分泌物。还可能伴有下腹痛、白带异常等症状。
4.其他：宫内节育器、子宫肌瘤、宫颈癌前病变或宫颈癌等也可能导致类似症状。
如果月经最后两天有褐色分泌物持续时间较长、出血量较多或伴有其他不适症状，建议及时就医，进行相关检查，如超声、激素六项等，以明确原因，并采取相应的治疗措施。
此外，需要注意的是，保持良好的生活习惯和心态对于维持月经的正常也非常重要。建议避免过度劳累、压力过大、情绪波动等，同时注意个人卫生，保持外阴清洁。如果对月经异常情况有疑虑，应及时咨询医生的建议。