月经最后两天有褐色分泌物，可能是以下原因导致：
1.黄体功能萎缩不全：黄体功能萎缩不全可能导致子宫内膜不规则脱落，使月经后期出血量少，经血排出不畅，在阴道内被氧化后呈现褐色。这种情况通常与第一次同房无关。
2.妇科疾病：一些妇科疾病，如阴道炎、宫颈炎、子宫内膜炎、子宫肌瘤等，可能导致月经异常，出现褐色分泌物。此外，子宫内膜息肉、宫颈癌等也可能引起类似症状。
3.宫内节育器：宫内节育器是一种常见的避孕工具，但有时可能会引起月经异常，包括褐色分泌物。
4.其他因素：如过度节食、作息不规律、精神压力过大等，也可能影响月经，导致褐色分泌物。
如果出现月经最后两天有褐色分泌物的情况，可以采取以下措施：
1.保持良好的生活习惯：保持规律的作息时间，避免熬夜；均衡饮食，避免过度节食；缓解压力，保持心情愉悦。
2.注意个人卫生：保持外阴清洁，勤换卫生巾。
3.观察症状：注意观察褐色分泌物的量、持续时间和伴随症状。如果症状持续时间较长、出血量较多或伴有其他不适，如腹痛、瘙痒等，应及时就医。
4.就医检查：医生会进行详细的妇科检查、B超等检查，以确定具体原因。根据检查结果，医生可能会给予相应的治疗建议。
需要注意的是，每个人的情况可能不同，如果对月经异常有疑虑，最好咨询医生以获得个性化的建议和诊断。此外，如果有性生活，还应排除怀孕相关的问题。