尿道两侧有小颗粒可能是由多种原因引起的，以下是一些可能的情况：
1.珍珠状阴茎丘疹：这是一种常见的良性病变，通常发生在龟头边缘和冠状沟处，表现为珍珠状、白色或淡红色的小颗粒，无明显症状。可能与生理发育异常、局部刺激或感染有关。一般不需要特殊治疗，注意局部清洁即可。
2.尖锐湿疣：由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起，主要通过性接触传播。病变初期为单个或多个散在的淡红色小丘疹，质地柔软，顶端尖锐，逐渐增大增多，可呈乳头样、鸡冠状或菜花样突起。常伴有瘙痒、疼痛、性交出血等症状。治疗方法包括物理治疗、药物治疗和免疫疗法等。
3.皮脂腺异位症：由于皮脂腺发育的生理性变型和皮脂腺增生所致。好发于口腔黏膜、阴茎龟头、阴唇及包皮内侧面。表现为针头大小、孤立的、黄白色小丘疹，无自觉症状。一般不需要治疗，也不会对健康造成影响。
4.假性湿疣：发生于女性小阴唇内侧，为多数淡红色或黏膜色的丘疹，对称分布，有的可呈息肉状或乳头状，也有的呈绒毛状或鱼子状。可能与念珠菌感染、滴虫感染或其他慢性刺激有关。通常无明显症状，也不需要特殊治疗。
5.其他：尿道炎、龟头炎、生殖器疱疹等疾病也可能导致尿道两侧出现小颗粒。
如果发现尿道两侧有小颗粒，建议及时就医，进行详细的检查和诊断。医生会根据具体情况制定合适的治疗方案。同时，注意个人卫生，保持局部清洁干燥，避免搔抓和摩擦，避免不洁性行为。