孕两个月出现褐色分泌物可能是以下原因导致的：
1.先兆流产：孕早期胚胎着床不稳定，过度劳累、剧烈运动、性生活等可能导致先兆流产，出现阴道少量出血，血液在阴道内停留时间较长，可表现为褐色分泌物。此时需要注意休息，避免劳累和性生活，同时及时就医，医生一般会建议进行孕酮、人绒毛膜促性腺激素（hCG）等检查，并根据检查结果采取保胎治疗，如口服黄体酮胶囊、地屈孕酮片等。
2.异位妊娠：受精卵在子宫体腔以外的部位着床发育，称为异位妊娠，以输卵管妊娠最常见。异位妊娠时，随着孕囊的生长，会导致输卵管破裂、出血，引起腹痛和阴道出血，出血量少时可表现为褐色分泌物。异位妊娠是一种非常危险的情况，需要及时就医，通过超声检查等明确诊断，并采取相应的治疗措施，如手术治疗或药物治疗。
3.宫颈息肉：宫颈息肉是宫颈管黏膜局部增生，形成的赘生物，息肉质地脆弱，容易出血，表现为性生活后或妇科检查后阴道出血。如果息肉位于宫颈口，也可能出现褐色分泌物。宫颈息肉通常需要手术切除，术后一般预后良好。
4.其他：阴道炎、宫颈炎、子宫肌瘤等也可能导致阴道出血，表现为褐色分泌物。
如果孕两个月出现褐色分泌物，建议及时就医，进行相关检查，明确原因，并在医生的指导下进行治疗。同时，孕妇应注意休息，避免劳累和性生活，保持心情愉悦，按时产检。