肩膀两侧长痘痘的原因比较复杂，以下是一些可能的原因：
1.痤疮：痤疮是一种常见的皮肤病，好发于青少年的面部、背部和胸部，但也可能出现在肩膀两侧。痤疮的发生与皮脂腺分泌过多、毛囊口角化、痤疮丙酸杆菌感染等因素有关。
2.马拉色菌毛囊炎：马拉色菌是一种真菌，当皮肤油脂分泌旺盛、出汗较多时，马拉色菌容易滋生，引发马拉色菌毛囊炎。这种疾病好发于颈部、前胸、肩背部等部位，表现为红色丘疹或脓疱。
3.细菌感染：如果肩膀两侧的痘痘是红色的、触碰时疼痛，可能是细菌感染引起的毛囊炎或疖肿。常见的细菌有金黄色葡萄球菌、链球菌等。
4.其他原因：
内分泌失调：内分泌失调可能导致皮脂腺分泌旺盛，从而引起痘痘。
饮食因素：高糖、高脂肪、高乳制品的饮食可能增加痤疮的发生风险。
药物因素：某些药物，如糖皮质激素、锂剂等，可能导致痤疮的发生。
遗传因素：痤疮的发生也可能与遗传有关。
如果肩膀两侧的痘痘持续不愈或伴有其他症状，建议及时就医，以便明确诊断并采取相应的治疗措施。以下是一些就医建议：
1.皮肤科就诊：皮肤科医生会根据痘痘的症状、分布部位、病史等进行详细的询问和检查，以确定痘痘的原因，并制定个性化的治疗方案。
2.可能的检查：医生可能会根据需要进行一些检查，如真菌镜检、细菌培养、内分泌检查等，以帮助明确诊断。
3.治疗方法：治疗方法包括外用药物、口服药物、物理治疗等，具体治疗方案会根据痘痘的类型和严重程度而定。
4.注意事项：在治疗期间，应注意保持皮肤清洁，避免搔抓和挤压痘痘，同时注意饮食清淡、作息规律，以促进痘痘的恢复。
对于特殊人群，如孕妇、儿童、老年人等，痘痘的治疗需要更加谨慎。在就医时，应告知医生自己的特殊情况，以便医生选择合适的治疗方法。此外，痘痘的治疗需要一定的时间，患者应耐心配合医生的治疗，并定期复诊。如果痘痘症状加重或出现其他异常情况，应及时就医。