孕晚期肛门一阵一阵痛，可能是以下原因引起：
1.胎儿入盆：孕晚期时，胎儿可能会入盆，这会压迫到直肠和肛门，导致疼痛。这种疼痛通常是间歇性的，而且在改变体位时可能会加重。
2.痔疮或肛裂：怀孕后，子宫逐渐增大，可能会压迫静脉，导致痔疮或肛裂。这些问题可能会引起肛门疼痛，尤其是在排便时。
3.宫缩：孕晚期可能会出现假性宫缩，这些宫缩可能会引起腹部和肛门的疼痛。假性宫缩通常是无痛性的，但有时也可能会有轻微的疼痛。
4.其他原因：其他可能导致肛门疼痛的原因包括直肠炎、肛周脓肿等。
如果肛门疼痛持续或加重，或者伴有其他症状，如阴道出血、破水、腹痛等，应及时就医。医生可能会进行详细的检查，以确定疼痛的原因，并给予相应的治疗建议。
在孕晚期，以下措施可能有助于缓解肛门疼痛：
1.保持良好的饮食习惯，增加膳食纤维的摄入，以预防便秘。
2.多喝水，保持身体水分充足。
3.避免长时间站立或坐着，适当活动。
4.保持肛门清洁，便后用温水清洗。
5.按照医生的建议进行产前检查。
需要注意的是，以上建议仅供参考。如果您对肛门疼痛有任何疑虑或担忧，最好咨询医生的意见。医生会根据您的具体情况提供个性化的建议和治疗方案。