孕中期肛门一阵一阵疼可能由以下原因引起：
1.痔疮或肛裂：怀孕后，子宫逐渐增大，可能压迫静脉，导致痔静脉回流受阻，引起痔疮或肛裂，导致肛门疼痛。
2.便秘：孕期活动减少，肠蠕动减慢，容易引起便秘，排便时过度用力可能导致肛门疼痛。
3.其他：如肛周炎、肛周脓肿等也可能引起肛门疼痛。
针对以上原因，可以采取以下措施：
1.调整饮食：增加膳食纤维的摄入，多喝水，避免辛辣刺激性食物，预防便秘。
2.养成良好的排便习惯：每天定时排便，避免排便时间过长。
3.注意肛门卫生：保持肛门清洁，便后清洗。
4.适度运动：适量的运动可以促进肠蠕动，缓解便秘。
5.就医治疗：如果疼痛持续不缓解或伴有其他症状，如发热、出血等，应及时就医，明确病因，并在医生的指导下进行治疗。
需要注意的是，在孕期使用药物需要谨慎，应在医生的指导下选择安全的药物。同时，如果疼痛严重或持续不缓解，应及时就医，以确保孕妇和胎儿的健康。