巧克力囊肿多大需要手术，不能一概而论，需要综合考虑囊肿的大小、症状、年龄、生育需求等因素。一般来说，以下情况可能需要手术治疗：
1.囊肿直径大于5厘米：巧克力囊肿可能会逐渐增大，较大的囊肿可能会引起腹痛、性交痛、月经异常等不适，还可能发生囊肿破裂、扭转等并发症。因此，直径大于5厘米的囊肿通常需要手术治疗。
2.药物治疗无效：如果巧克力囊肿较小，但出现了明显的痛经、性交痛等症状，或药物治疗（如避孕药、孕激素等）效果不佳，可能需要考虑手术治疗。
3.有生育需求：巧克力囊肿可能会影响卵巢功能，导致排卵障碍，从而影响受孕。对于有生育需求的女性，手术治疗可能有助于提高受孕机会。
4.囊肿持续存在或复发：手术后巧克力囊肿可能会复发，如果囊肿持续存在或多次复发，可能需要进一步手术或其他治疗方法。
5.怀疑恶变：如果超声检查或其他检查怀疑巧克力囊肿恶变，应及时手术治疗。
需要注意的是，手术治疗的方式包括腹腔镜手术和开腹手术等，具体选择哪种手术方式应根据患者的具体情况而定。此外，手术后还需要定期复查，以监测病情的变化。
总之，巧克力囊肿的治疗需要综合考虑多种因素，患者应在医生的指导下选择合适的治疗方案。如果对巧克力囊肿的治疗有疑问，应及时与医生沟通，以便获得更专业的建议。