阴茎根部隐隐作痛可能由多种原因引起，以下是一些可能的原因和建议：
1.前列腺炎或前列腺增生：男性前列腺位于阴茎根部附近，炎症或增生可能导致疼痛。此外，还可能伴有尿频、尿急、尿痛等症状。建议及时就医，进行前列腺相关检查，如前列腺液常规、超声等，以明确诊断，并根据医生的建议进行治疗。
2.尿道炎或膀胱炎：这些泌尿系统感染也可能引起阴茎根部疼痛，同时可能伴有尿频、尿急、尿痛、尿液混浊等症状。医生一般会根据感染的类型给予抗生素治疗。
3.精索静脉曲张：精索静脉曲张是精索内蔓状静脉丛的异常扩张、伸长和迂曲，可导致阴囊内温度升高，影响精子发生。患者可能会感到阴囊下坠、胀痛，有时可累及阴茎根部。医生会通过超声等检查来确诊，治疗方法包括药物治疗、手术治疗等。
4.阴茎硬结症：阴茎海绵体白膜的纤维化病变，可导致阴茎弯曲畸形，伴有疼痛和勃起功能障碍。需要就医进行详细的检查和评估，可能需要接受药物或手术治疗。
5.其他原因：阴茎根部的损伤、阴茎癌、附睾炎、腹股沟疝等也可能引起疼痛。
总之，阴茎根部隐隐作痛可能是多种疾病的表现，如果疼痛持续或加重，建议及时就医，进行详细的检查和诊断，以便采取适当的治疗措施。
对于特殊人群，如老年人、糖尿病患者、免疫功能低下者等，阴茎根部疼痛可能与其他健康问题有关，更应引起重视，及时就医。此外，保持良好的生活习惯，如避免久坐、注意个人卫生、均衡饮食等，对维护男性生殖健康也很重要。