早上起来第一口痰是褐色的，可能是以下原因引起：
1.鼻腔或鼻咽部出血：血液经后鼻孔流至口咽部，可表现为痰中带血或回吸涕中带血。
病因：鼻腔或鼻咽部炎症、鼻中隔偏曲、鼻咽部肿瘤、外伤等。
原理：上述病因可导致局部毛细血管破裂出血，血液经口腔咳出。
2.口腔出血：牙龈出血、口腔溃疡等口腔疾病可导致痰中带血。
病因：牙龈炎、牙周炎、口腔溃疡等。
原理：口腔内的血管破裂或渗出，血液混入痰液中。
3.呼吸道疾病：急慢性咽喉炎、气管支气管炎、肺炎等疾病也可能导致痰中带血。
病因：感染、理化因素刺激、过敏反应等。
原理：炎症或其他因素导致呼吸道黏膜受损，血管通透性增加，血液渗出。
4.其他原因：如心血管疾病、血液系统疾病、呼吸系统临近器官疾病等也可能引起痰中带血。
如果出现早上起来第一口痰是褐色的情况，建议及时就医，进行相关检查，如鼻腔镜、喉镜、胸部X线或CT等，以明确病因，并采取相应的治疗措施。同时，要注意保持口腔卫生，多喝水，避免食用辛辣刺激性食物。