跑步时肾痛可能是由以下原因引起的：
1.肾脏位置异常：肾脏位于腹膜后，当身体位置发生改变时，肾脏可能会移动，牵扯到肾脏的被膜或肾盂、输尿管，导致疼痛。
2.肾脏疾病：如肾小球肾炎、肾盂肾炎、肾结石、肾肿瘤等，这些疾病可能导致肾脏结构或功能异常，引起疼痛。
3.腰部肌肉或脊柱问题：腰部肌肉拉伤、扭伤、腰椎间盘突出等问题可能导致疼痛放射到肾脏区域。
4.运动过度或不当：长时间或高强度的跑步可能导致腰部肌肉疲劳、拉伤，或引起肾脏血液循环障碍。
5.其他因素：如感染、过敏、血管炎等也可能引起肾痛。
如果在跑步时出现肾痛，应立即停止运动，采取以下措施：
1.休息：让身体得到充分的休息，避免进一步加重疼痛。
2.热敷：用热水袋或热毛巾敷在疼痛部位，缓解肌肉紧张和疼痛。
3.按摩：轻轻按摩疼痛部位，帮助放松肌肉。
4.补充水分：保持身体水分充足，有助于缓解疼痛。
5.观察症状：密切观察疼痛的程度、持续时间以及是否出现其他症状，如发热、恶心、呕吐等。
如果肾痛持续不缓解或伴有其他严重症状，如血尿、蛋白尿、呼吸困难等，应及时就医，进行详细的检查，如肾脏超声、CT等，以确定疼痛的原因，并采取相应的治疗措施。
在日常生活中，为了预防跑步时肾痛的发生，可以采取以下措施：
1.做好热身和拉伸运动，充分活动身体。
2.逐渐增加跑步的强度和时间，避免过度疲劳。
3.保持正确的跑步姿势，避免弯腰或扭曲身体。
4.选择合适的跑鞋，提供良好的支撑和缓冲。
5.注意身体的保暖，避免寒冷刺激。
6.定期进行身体检查，及时发现和治疗潜在的健康问题。
需要注意的是，肾痛也可能是其他疾病的症状，如上述提到的肾脏疾病、腰部肌肉或脊柱问题等。因此，如果经常出现肾痛，或伴有其他异常症状，应及时就医，进行全面的检查和诊断，以便采取适当的治疗措施。