同房时小肚子疼可能是多种原因引起，需结合具体情况分析。
一、生理性因素
- 女性在同房时，若动作过于剧烈，可能会引起腹部肌肉短暂性紧张收缩，导致小肚子疼，一般休息后可缓解。比如性生活中幅度较大、用力过猛时较易出现。
- 女性排卵期时，卵泡破裂可能伴有轻微腹痛，若此时同房，可能会加重这种感觉，一般疼痛较轻微且呈一过性。
二、妇科疾病因素
- 盆腔炎：女性盆腔存在炎症时，同房刺激会使炎症部位受牵拉，引发小肚子疼，还可能伴有白带异常、腰骶部酸痛等症状。常见于有不洁性生活史、多次宫腔操作史的女性。
- 子宫内膜异位症：异位的子宫内膜在同房时受刺激，会引起疼痛，多为深部性交痛，且随病情进展可能逐渐加重，还可能影响生育。
三、男科疾病因素
- 前列腺炎：男性患有前列腺炎时，同房后前列腺充血水肿，可导致小肚子疼，还可能出现尿频、尿急、尿痛等症状，久坐、饮酒等因素可能诱发或加重病情。
四、其他因素
- 心理因素：若双方心理紧张、不放松，可能在同房时感觉小肚子疼，放松心情后可能缓解。比如首次同房时过于紧张的人群。
如果同房时小肚子疼频繁出现或疼痛较剧烈，应及时就医，进行相关检查，如妇科检查、男科检查、B超等，以明确原因，并采取相应的处理措施。同时，性生活中应注意动作轻柔，营造轻松氛围，如有疾病应积极治疗。