引起腰疼、小肚子下坠且隐隐痛的原因有很多，以下是一些常见的原因：
1.盆腔炎：女性生殖系统有自然的防御功能，在正常情况下，能抵御细菌的入侵，只有当机体的抵抗力下降，或由于其他原因使女性的自然防御功能遭到破坏时，才会导致盆腔炎的发生。盆腔炎是女性上生殖道及其周围组织的炎症，主要包括子宫内膜炎、输卵管炎、输卵管卵巢脓肿、盆腔腹膜炎。炎症可局限于一个部位，也可同时累及几个部位，最常见的是输卵管炎、输卵管卵巢炎。盆腔炎多发生在性活跃期、有月经的妇女，初潮前、绝经后或未婚者很少发生盆腔炎。若发生盆腔炎也往往是邻近器官炎症的扩散。按其发病过程、临床表现可分为急性与慢性两种。
急性盆腔炎：症状可因炎症的轻重与范围大小而有不同。病人常有高热、寒战、下腹疼痛伴恶心、呕吐、腹胀、腹泻等消化系统症状。如有脓肿形成，可有下腹包块及局部压迫刺激症状，如膀胱刺激症状和直肠刺激症状，呈排尿困难、尿频、尿痛、腹泻，里急后重感和排便困难。
慢性盆腔炎：全身症状多不明显，有时可有低热，易感疲劳。病程时间较长，部分患者可有神经衰弱症状，如精神不振、周身不适、失眠等。当患者抵抗力差时，易有急性或亚急性发作。
治疗：主要为抗生素药物治疗，必要时手术治疗。
2.宫颈炎：宫颈炎是妇科常见疾病之一，多见于育龄妇女，为宫颈受损伤和病原体侵袭而致，包括子宫颈阴道部炎症及子宫颈管黏膜炎症。宫颈炎症可导致女性发生白带增多、腰痛、下腹坠胀、痛经等症状，严重影响女性的日常生活和工作。
急性宫颈炎：主要表现为阴道分泌物增多，呈黏液脓性，阴道分泌物的刺激可引起外阴瘙痒及灼热感。此外，可出现经间期出血、性交后出血等症状。若合并尿路感染，可出现尿急、尿频、尿痛。
慢性宫颈炎：多无症状，少数患者可有阴道分泌物增多，淡黄色或脓性，性交后出血，月经间期出血，偶有分泌物刺激引起外阴瘙痒或不适。妇科检查可发现子宫颈呈糜烂样改变，或有黄色分泌物覆盖子宫颈口或从子宫颈口流出，也可表现为子宫颈息肉或子宫颈肥大。
治疗：主要为抗生素药物治疗。有性传播疾病高危因素的患者，尤其是年轻女性，未获得病原体检测结果前，需采用针对淋病奈瑟菌及沙眼衣原体的药物，对于获得病原体者，针对病原体选择抗生素。
3.异位妊娠：指所有发生在子宫以外的妊娠，而异位妊娠是妇产科常见的急腹症之一，若不及时诊断和积极治疗，可能导致大出血。异位妊娠以输卵管妊娠最常见，占95%左右。主要临床表现为停经后腹痛与阴道流血。
停经：除输卵管间质部妊娠停经时间较长外，多有6～8周停经。有20%～30%患者无明显停经史，或月经仅过期两三日。
腹痛：是输卵管妊娠患者就诊的主要原因。输卵管妊娠发生流产或破裂之前，表现为一侧下腹部隐痛或酸胀感。当发生流产或破裂时，患者突感一侧下腹部撕裂样疼痛，常伴有恶心、呕吐。若血液积聚在子宫直肠陷凹，可有肛门坠胀感。
阴道流血：胚胎死亡后，常有不规则阴道流血，色黯红，量少，一般不超过月经量。少数患者阴道流血量较多，类似月经，阴道流血可伴有蜕膜碎片排出。
晕厥与休克：由于腹腔内急性出血，可引起血容量减少及剧烈腹痛，轻者常有晕厥，重者出现失血性休克。
治疗：包括期待治疗、药物治疗、手术治疗和中医治疗。
4.先兆流产：指妊娠28周前，先出现少量的阴道流血、继而出现阵发性下腹部疼痛或腰痛，盆腔检查宫口未开，胎膜完整，无妊娠物排出，子宫大小与孕周相符。如症状加重，可能发展为难免流产。
主要症状：为先兆流产，多为咖啡色分泌物或少量阴道流血。在流血发生后数小时至数日后，可伴有下腹疼痛，有时阵痛可发展为持续下腹疼痛。
检查：妇科检查宫颈口未开，子宫大小与停经周数相符。
治疗：卧床休息，禁忌性生活，减少刺激。黄体功能不足者，可给予黄体酮肌内注射。维生素E具有保胎作用，也可选用。针对病因进行治疗，如积极治疗阴道炎、宫颈炎等。经过治疗，引起流产的原因被消除，则出血停止，妊娠可以继续。
5.其他：除以上原因外，子宫内膜异位症、子宫肌瘤、子宫腺肌病等疾病也可导致出现腰疼、小肚子下坠且隐隐痛的症状。
总之，引起腰疼、小肚子下坠且隐隐痛的原因有很多，如果症状持续不缓解或加重，建议及时就医，明确病因，以便进行针对性治疗。