3个月婴儿有痰，可采取以下方法帮助祛痰：
1.多喝温水：水能稀释痰液，缓解喉咙中的痰液，使其更容易咳出。
2.拍背排痰：让婴儿侧卧，五指稍屈，握成空手拳，由外向内，由下向上，轻拍宝宝背部，两侧交替进行，拍3分钟左右，可促使宝宝肺部和支气管内的痰液松动，有利咳出。
3.蒸汽法：将沸水倒入杯子中，抱起孩子，让其口鼻对着升起的水蒸气并吸放，可使痰液变稀利于咳出，还可减轻气管与支气管黏膜的充血和水肿，减少咳嗽。
4.药物治疗：如果宝宝咳嗽有痰的情况较为严重，应及时就医，在医生的指导下使用祛痰药物。
需要注意的是，3个月的婴儿各器官尚未发育成熟，不建议自行用药，以免对宝宝造成不良影响。