早上醒来头疼，可能与以下原因有关。
1.睡眠呼吸暂停综合征：（1）睡眠中气道狭窄或阻塞，导致呼吸不畅，（2）反复出现呼吸暂停和低氧血症，（3）引起脑血管扩张，牵拉刺激脑膜和血管神经末梢，引发头疼。
2.颈椎病：（1）颈椎病变可刺激椎动脉周围的交感神经丛或颈部其他交感神经，（2）使椎动脉痉挛，供血不足，（3）反射性地引起颅内血管扩张，牵拉刺激血管痛觉末梢，引发头疼。
3.高血压：（1）血压波动，（2）大脑皮层功能失调，（3）颅内血管舒缩功能紊乱，（4）牵拉刺激血管痛觉末梢，引发头疼。
4.颅内占位性病变：（1）肿瘤、血肿、脓肿等，（2）使颅内压增高，（3）牵拉脑膜、血管及痛觉敏感结构，引发头疼。
5.神经症：（1）当受到外界环境刺激，（2）或长期的心理压力、情绪紧张，（3）可引起大脑功能活动紊乱，（4）引发头疼。
如果早上醒来头疼持续不缓解，或伴有其他症状，如恶心、呕吐、视力模糊、肢体麻木等，建议及时就医，明确病因，以便进行针对性治疗。同时，保持良好的睡眠习惯，避免熬夜、过度劳累，适当运动，有助于缓解头疼。