三个月大的宝宝消化不良、肚子胀，可能是由于以下原因：
1.饮食问题：宝宝可能吃了过多的奶或其他食物，导致消化不良。此外，如果宝宝吃了含有过多乳糖或蛋白质的食物，也可能引起肚子胀。
2.消化系统问题：宝宝的消化系统可能还不够成熟，无法有效地消化食物。这可能导致食物在肠道中发酵，产生气体，引起肚子胀。
3.过敏反应：宝宝可能对某些食物或物质过敏，导致消化不良和肚子胀。
4.肠道问题：宝宝可能患有肠道疾病，如肠炎或肠梗阻，这也可能导致肚子胀。
以下是一些解决宝宝消化不良和肚子胀的方法：
1.调整饮食：如果宝宝是母乳喂养，妈妈可以尝试减少自己的饮食中脂肪和蛋白质的摄入量。如果宝宝是配方奶喂养，可以尝试更换一种配方奶。此外，每次喂奶后，轻轻拍打宝宝的背部，帮助排出胃中的气体。
2.按摩：轻轻按摩宝宝的肚子，帮助促进肠道蠕动，缓解肚子胀。可以在宝宝的肚子上涂上一些按摩油，然后用顺时针的方向轻轻按摩。
3.给宝宝服用益生菌：益生菌可以帮助调节肠道菌群，促进消化。可以在医生的建议下，给宝宝服用适量的益生菌。
4.就医：如果宝宝的肚子胀持续时间较长，或者伴有其他症状，如呕吐、腹泻、发热等，应该及时就医。医生可能会建议进行一些检查，如腹部X光或血液检查，以确定宝宝的具体情况，并给出相应的治疗建议。
需要注意的是，在给宝宝服用任何药物之前，最好先咨询医生的意见。此外，宝宝的肚子胀可能是由于其他健康问题引起的，如果症状持续不缓解或加重，应该及时就医。