9岁小孩阴茎短小的原因可能有以下几点：
1.遗传因素：阴茎的大小与遗传因素有关。如果家族中有阴茎短小的成员，孩子也可能会受到影响。
2.发育迟缓：如果孩子的整体发育迟缓，包括身高、体重等方面，那么阴茎的发育也可能会受到影响。
3.肥胖：肥胖会导致腹部脂肪堆积，从而使阴茎看起来短小。
4.内分泌失调：某些疾病或药物可能会影响内分泌系统，导致阴茎发育异常。
5.其他因素：如染色体异常、睾丸发育不良等也可能导致阴茎短小。
需要注意的是，9岁小孩的阴茎还在发育过程中，不能仅凭外观判断阴茎是否短小。如果家长对孩子的阴茎发育有疑虑，建议及时咨询医生，进行详细的检查和评估。医生会根据具体情况给出相应的建议和治疗方案。同时，家长也应该注意孩子的营养均衡、健康生活方式等，以促进孩子的身体发育。