月经来后的第三天同房是否会怀孕，需要根据具体情况来判断。一般来说，月经周期规律的女性，月经来后的第三天属于安全期，怀孕的概率较低，但也不能完全排除怀孕的可能。以下是一些可能的情况：
1.安全期避孕：安全期避孕并不一定可靠，因为女性的排卵时间可能会受到情绪、环境、健康状况等因素的影响而发生变化。如果月经周期不规律，或者存在其他影响排卵的因素，那么安全期避孕就不是一种有效的方法。
2.额外排卵：有些女性可能会出现额外排卵的情况，即在安全期也会排卵。这种情况虽然比较少见，但仍然存在一定的风险。
3.精子在体内的存活时间：精子在女性体内可能会存活数天，即使在安全期，也不能完全排除精子在女性体内等待卵子排出的可能性。
需要注意的是，每个人的身体状况和生理反应都可能不同，以上只是一些常见的情况。如果您担心怀孕，建议采取可靠的避孕措施，如使用避孕套、口服避孕药等。此外，如果您对自己的月经周期和排卵情况不确定，或者有其他生育方面的问题，建议咨询医生或专业的医疗机构，以获取更准确和个性化的建议。
对于特殊人群，如青春期少女、更年期女性等，由于她们的生理特点和激素水平的变化，怀孕的风险和注意事项可能会有所不同。在这些情况下，更应该咨询医生的意见，以确保自己的健康和安全。同时，无论年龄大小，保持良好的性生活卫生和健康习惯都是非常重要的。