在来月经第三天同房一般不会怀孕，但可能会引起感染或其他问题。
一、怀孕的概率较低
在月经周期中，女性通常在排卵期间受孕的几率较高。而排卵通常发生在下次月经来潮前的14天左右。在月经的第三天，卵子尚未发育成熟，子宫内膜也不适合受精卵着床，因此怀孕的概率较低。
然而，需要注意的是，安全期并不绝对安全，排卵时间可能会因个体差异和其他因素而有所变化。即使在月经期间，仍有可能发生意外排卵，导致怀孕的情况。
二、感染的风险
月经期间，女性的子宫内膜正在脱落，子宫颈口也微微张开，这为细菌提供了一个入口。同房时，细菌可能会被带入子宫，引发感染。常见的感染包括子宫内膜炎、盆腔炎等。此外，月经期间同房还可能增加经血逆流的风险，导致子宫内膜异位症的发生。
三、其他问题
除了感染风险外，月经期间同房还可能导致以下问题：
1.加重经期不适：同房可能会引起子宫收缩，导致腹痛、腰痛等经期不适症状加重。
2.免疫反应：同房时的刺激可能引发免疫反应，导致身体产生抗体，对精子或子宫内膜产生免疫排斥，从而影响受孕能力。
四、建议
为了避免感染和其他潜在问题，建议在月经期间避免同房。如果有性需求，可以选择在月经结束后进行。此外，以下几点也很重要：
1.保持个人卫生：在月经期间，勤换卫生巾，保持外阴清洁干燥。
2.避免坐浴和使用阴道冲洗：坐浴和阴道冲洗可能会将细菌带入子宫，增加感染的风险。
3.注意休息：月经期间身体较为虚弱，应注意休息，避免过度劳累和剧烈运动。
4.关注身体变化：如果在月经期间同房后出现异常症状，如发热、腹痛、白带异常等，应及时就医。
总之，虽然在来月经第三天同房怀孕的概率较低，但仍存在感染和其他问题的风险。为了保护自己的健康，建议在月经期间避免同房。如果对月经期间的性行为有任何疑虑或担忧，最好咨询医生的意见。同时，也要尊重伴侣的意愿，共同维护健康的性生活。