每天早上起来肚子疼，上完厕所就好了，可能是以下原因导致：
1.肠易激综合征：
病因：精神心理障碍、内脏高敏感性、肠道感染/炎症、肠道微生态失衡等因素都可能引起肠易激综合征。
原理：当肠道受到刺激时，肠道蠕动加快，导致腹痛，排便后，刺激解除，腹痛缓解。
治疗方法：
调整饮食：避免食用辛辣、油腻、刺激性食物，增加膳食纤维的摄入。
心理治疗：如认知行为疗法，可帮助减轻焦虑和抑郁情绪。
药物治疗：使用解痉药、止泻药、益生菌等。
2.溃疡性结肠炎：
病因：病因尚不明确，可能与环境、遗传、免疫等因素有关。
原理：溃疡性结肠炎可导致结肠黏膜炎症和溃疡，炎症刺激肠道，引起腹痛和腹泻。
治疗方法：
药物治疗：使用氨基水杨酸制剂、糖皮质激素、免疫抑制剂等。
手术治疗：对于严重或药物治疗无效的患者，可能需要手术治疗。
3.其他疾病：
慢性胆囊炎：胆囊炎症可引起右上腹疼痛，有时会放射至右肩部，晨起时症状明显，排便后可缓解。
其他：如慢性胰腺炎、克罗恩病等也可能出现类似症状。
需要注意的是，以上只是一些可能的原因，具体诊断需要结合病史、体征、实验室检查等综合判断。如果症状持续不缓解或伴有其他症状，建议及时就医，明确病因，以便进行针对性治疗。此外，保持良好的生活习惯，如规律作息、适量运动、减轻压力等，也有助于缓解症状。