怀孕三个月肚子疼类似痛经，可能是以下原因引起：
1.子宫增大：怀孕后，子宫会逐渐增大，以适应胎儿的生长发育。在这个过程中，子宫可能会出现牵拉痛或不适感，类似于痛经。
2.子宫收缩：在怀孕早期，子宫可能会出现不规则的收缩，这可能会导致肚子疼，但通常不会很强烈。这种收缩通常是无害的，称为生理性宫缩。
3.其他原因：
先兆流产：如果肚子疼伴有阴道出血，可能是先兆流产的迹象。需要及时就医，医生可能会建议卧床休息、使用药物等进行保胎治疗。
宫外孕：宫外孕是指受精卵在子宫以外的部位着床，如输卵管。宫外孕可能会导致肚子疼和阴道出血，需要及时就医，进行治疗，以避免严重后果。
其他并发症：怀孕期间，还可能出现其他并发症，如阑尾炎、胆囊炎等，这些疾病也可能导致肚子疼，需要医生进行诊断和治疗。
如果怀孕三个月时出现肚子疼类似痛经的情况，建议及时就医，进行详细的检查，以确定原因，并采取相应的治疗措施。同时，孕妇应注意休息，避免剧烈运动和性生活，保持良好的心态，如有异常应及时告知医生。