男生上完小便后尿道会刺疼，可能是以下原因引起：
1.尿道炎：尿道炎是尿道黏膜的炎症，可由细菌、病毒等感染引起。除了尿道刺疼，还可能伴有尿频、尿急、尿道口红肿等症状。治疗尿道炎通常采用抗生素，如左氧氟沙星、阿莫西林等。
2.膀胱炎：膀胱炎是膀胱黏膜的炎症，也可能导致小便后尿道刺疼。同时，患者可能会出现尿频、尿急、尿痛等症状，甚至可能出现血尿。膀胱炎的治疗方法与尿道炎类似，常用药物有头孢呋辛酯、磺胺嘧啶等。
3.前列腺炎：前列腺炎是男性前列腺的炎症，除了尿道刺疼，还可能伴有会阴部、耻骨上区、腹股沟区等部位的疼痛不适，以及排尿异常、性功能障碍等症状。前列腺炎的治疗方法包括药物治疗（如前列康、前列舒通等）、物理治疗（如微波、射频等）和手术治疗（如前列腺电切术等）。
4.泌尿系统结石：泌尿系统结石如肾结石、输尿管结石等，也可能导致小便后尿道刺疼。此外，还可能出现血尿、恶心、呕吐等症状。治疗泌尿系统结石的方法包括药物排石、体外冲击波碎石、输尿管镜取石等。
5.其他原因：除了上述疾病，其他原因如尿道口狭窄、尿道损伤、尿道憩室等也可能导致小便后尿道刺疼。
如果男生出现小便后尿道刺疼的症状，建议及时就医，进行相关检查（如尿常规、尿培养、超声等），以明确病因，并采取相应的治疗措施。同时，在治疗期间应注意个人卫生，多喝水，避免憋尿，少吃辛辣刺激性食物。