月经第三天肚子疼，可能是以下原因引起：
1.前列腺素水平升高：月经期间，子宫内膜前列腺素含量升高，可引起子宫平滑肌过强收缩，血管挛缩，造成子宫缺血、乏氧状态而出现痛经。
2.精神、神经因素：部分女性对疼痛过分敏感，精神、神经因素也会增加疼痛的敏感性，即对疼痛的感知和反应加重。
3.其他：疼痛还常与子宫肌痉挛、子宫颈管狭窄、子宫位置不正、经血排出不畅等因素有关。
如果疼痛不严重，可以通过以下方法缓解：
1.注意保暖：使用热水袋或热毛巾敷在腹部，可促进血液循环，缓解疼痛。
2.饮食调整：避免食用辛辣、生冷等刺激性食物，可适量饮用红糖水，缓解疼痛。
3.适当运动：进行适量的运动，如散步、瑜伽等，可促进子宫收缩，缓解疼痛。
4.药物治疗：如果疼痛严重，可在医生的指导下使用止痛药。
如果疼痛持续不缓解或伴有其他症状，如恶心、呕吐、头晕等，应及时就医，进行详细的检查，以排除其他疾病的可能。