牙根发黑可能是以下原因导致的：
1.外源性因素：
长期吸烟：烟草中的尼古丁等有害物质会沉着在牙齿表面，导致牙根发黑。
长期饮茶、咖啡、红酒等：这些饮料中的色素也可能会附着在牙齿上，使牙根变黑。
口腔卫生不良：不及时刷牙、不使用牙线等，会导致食物残渣和细菌在牙齿周围滋生，形成牙菌斑和牙结石，进而使牙根变黑。
2.内源性因素：
牙髓坏死：牙髓是牙齿内部的组织，当牙髓发生感染或坏死时，会导致牙齿变黑。
四环素类药物：在牙齿发育期间使用四环素类药物，会导致牙齿变色，牙根也可能会变黑。
氟斑牙：如果饮用水中氟含量过高，会导致牙齿出现氟斑，使牙根变黑。
牙釉质发育不全：牙齿在发育过程中，如果受到某些因素的影响，会导致牙釉质发育不全，使牙根暴露，容易受到外界因素的影响而变黑。
如果发现牙根发黑，建议及时就医，医生会根据具体情况进行诊断和治疗。同时，保持良好的口腔卫生习惯，定期洗牙、检查，可以有效预防牙根发黑等问题的发生。