牙齿牙根发黑可能是以下原因导致的：
1.外源性因素：
长期吸烟：烟草中的尼古丁等有害物质会使牙齿表面的菌斑和牙石沉着，导致牙齿变黑。
长期饮茶、咖啡、红酒等：这些饮料中的色素容易沉积在牙齿表面，使牙齿逐渐变黑。
口腔卫生不良：不及时刷牙、不使用牙线等，会导致食物残渣和细菌在牙齿周围滋生，形成牙菌斑和牙结石，进而使牙齿变黑。
2.内源性因素：
牙髓坏死：牙髓坏死是牙齿变黑的常见原因之一。当牙髓受到感染或损伤时，牙髓组织会死亡，细菌和分解产物会从根管中渗出，导致牙齿变黑。
四环素牙：在牙齿发育期间，服用了四环素类药物，这些药物会与牙齿中的钙结合，形成四环素牙，使牙齿呈现出黄色或棕色的斑块。
氟斑牙：长期饮用含氟量过高的水，或使用含氟牙膏不当，会导致牙齿表面出现白色或棕色的斑块，严重时会使牙齿变黑。
3.其他因素：
年龄增长：随着年龄的增长，牙齿的颜色可能会逐渐变暗。
牙齿受过外伤：牙齿受过外伤，如撞击、摔伤等，可能会导致牙髓坏死，进而使牙齿变黑。
如果发现牙齿牙根发黑，建议及时就医，医生会根据具体情况进行诊断和治疗。一般来说，治疗方法包括洗牙、牙齿美白、根管治疗等。同时，保持良好的口腔卫生习惯，定期洗牙和检查，有助于预防牙齿牙根发黑的发生。