百香果的籽可以吃，其含有超纤维等物质，能够促进排泄，缓解便秘症状，有助于清除黏附滞留在肠道的刺激性物质，避免刺激肠道和被人体再吸收，从而减少结肠癌的患病率，超纤维还具有抗肿瘤活性。百香果的籽中含有丰富的维生素、超氧化物歧化酶、硒以及各种微量元素，能增强免疫力，对机体起到保健作用，可降低血脂，防治动脉硬化，降低血压。百香果的籽可以直接吃，也可以泡水喝或做成果酱食用。
需要注意的是，百香果的籽不易消化，消化功能不好的人应少吃，以免引起消化不良。对百香果过敏的人禁止食用，以免出现过敏反应。百香果性凉，因此，寒性体质、胃不好的人及处于经期的女性应少吃。