手指甲变厚的治疗方法主要有以下几种：
1.外用药物：使用抗真菌药物，如阿莫罗芬搽剂，涂抹在指甲上，帮助抑制真菌生长。
2.口服药物：对于较为严重的灰指甲，可能需要口服抗真菌药物，如伊曲康唑、特比萘芬等，这些药物可以从内部消灭真菌。
3.手术治疗：在某些情况下，医生可能会建议进行病甲拔除或病甲清创手术，以彻底清除感染组织。
4.其他治疗：保持指甲清洁、干燥，避免长时间浸泡在水中；穿透气的鞋子，选择合适的袜子，减少真菌感染的机会；定期修剪指甲，避免指甲过长滋生细菌。
指甲变厚的主要原因是真菌感染，即灰指甲。灰指甲是由皮肤癣菌、酵母菌和非皮肤癣菌等真菌感染引起的甲病变。这些真菌会侵蚀指甲，导致指甲变形、增厚、变色，并出现鳞屑、裂纹等症状。
需要注意的是，治疗灰指甲需要耐心和坚持。药物治疗通常需要数月甚至更长时间，才能彻底消灭真菌。同时，个人卫生和预防措施也非常重要，以避免再次感染。如果灰指甲症状严重或持续不愈，建议及时就医，以便获得更专业的治疗建议。