背部肩胛骨疼痛的原因可能有以下几点：
一、肩部疾病
1.肩周炎
肩周炎可导致肩关节周围疼痛，活动受限，疼痛可放射至肩胛骨部位。
2.肩袖损伤
肩袖损伤多由于外伤或过度使用引起，可导致肩部疼痛、无力，活动受限。
3.颈椎病
颈椎间盘突出、颈椎管狭窄等颈椎病可压迫神经根，引起肩部及上肢疼痛、麻木。
二、胸部疾病
1.胸膜炎
胸膜炎可导致胸部及背部疼痛，深呼吸、咳嗽时疼痛加重。
2.肺炎
肺炎可引起胸部疼痛，伴有咳嗽、咳痰等症状。
3.肺癌
肺癌可侵犯胸膜或纵隔，引起背部肩胛骨疼痛，常伴有咳嗽、咯血、消瘦等症状。
三、其他原因
1.心脏疾病
心绞痛、心肌梗死等心脏疾病可引起背部肩胛骨疼痛，常伴有胸闷、气短等症状。
2.肌肉劳损
长时间保持同一姿势或过度劳累可导致背部肌肉劳损，引起疼痛。
3.外伤
背部肩胛骨受到外伤，如撞击、挤压等，可导致软组织损伤或骨折，引起疼痛。
4.强直性脊柱炎
强直性脊柱炎可侵犯脊柱及周围关节，导致背部疼痛、僵硬，活动受限。
5.骨质疏松
骨质疏松可导致脊柱骨折，引起背部疼痛。
总之，背部肩胛骨疼痛的原因较多，如疼痛持续不缓解或伴有其他症状，应及时就医，明确病因，以便进行针对性治疗。