甲硝唑和奥硝唑都是硝基咪唑类抗生素，用于治疗各种厌氧菌感染和滴虫感染。但两者在化学结构、药效学、药动学和不良反应等方面存在一些区别。以下是甲硝唑与奥硝唑的区别：
1.化学结构：甲硝唑是2-甲基-5-硝基咪唑-1-乙醇；奥硝唑是1-（2-羟乙基）-2-甲基-5-硝基咪唑。
2.药效学：奥硝唑的抗菌谱比甲硝唑更广，对脆弱拟杆菌等厌氧菌的抗菌活性更强。
3.药动学：奥硝唑的半衰期比甲硝唑更长，血药浓度比甲硝唑更高，因此作用时间更长。
4.不良反应：奥硝唑的不良反应比甲硝唑更少更轻，主要是胃肠道反应和头痛，偶见白细胞减少。甲硝唑的不良反应较多，除了胃肠道反应和头痛外，还可能引起过敏反应、白细胞减少、致畸等。
综上所述，奥硝唑在抗菌活性、药动学和不良反应方面均优于甲硝唑，是一种更理想的硝基咪唑类抗生素。但具体使用哪种药物，应根据患者的具体情况（如病情、年龄、过敏史等）和医生的建议来选择。