手指甲盖一碰就疼的原因有很多，可能是以下几种情况：
1.甲沟炎：甲沟及其周围组织的感染，多因甲沟刺伤、嵌甲或拔“倒皮刺”感染造成。初起时，指甲一侧的皮下组织发生红、肿、痛，有的可自行消退，有的却迅速化脓。脓液自甲沟一侧蔓延到甲根部的皮下及对侧甲沟，形成半环形脓肿。甲沟炎多无全身症状，如不切开引流，脓肿可向甲下蔓延，成为指甲下脓肿，在指甲下可见到黄白色脓液，使该部指甲与甲床分离。指甲下脓肿变可因异物直接刺伤指甲或指甲下的外伤性血肿感染引起。感染可变成慢性，甲基底部出现横嵴，并随着指甲生长，逐渐充满指甲近端。
2.甲癣：俗称“灰指甲”，是指皮癣菌侵犯甲板或甲下所引起的疾病。甲真菌病是由皮癣菌、酵母菌及非皮癣菌等真菌引起的甲感染。甲癣为皮肤癣菌病中最顽固难治的一种。可口服、外用药物，或手术拔甲。
3.指甲营养不良：指甲是由蛋白质组成，若平日指甲底部出现白色横纹，有可能是蛋白质不足，宜多吃豆、种子、果仁、蛋或肉类等食物。
4.其他：外伤、感染、肿瘤等也可能导致手指甲盖一碰就疼。
如果出现手指甲盖一碰就疼的情况，建议及时就医，明确诊断后进行针对性治疗。同时，要注意保持指甲清洁卫生，避免过度修剪指甲，避免接触刺激性物质。