乳糖不耐受
人体缺乏乳糖酶时，空腹喝牛奶，其中的乳糖无法被充分消化吸收，在肠道内被细菌发酵，产生气体，刺激肠道，就会出现拉肚子等症状。这在一些乳糖酶活性较低的人群中较为常见，不同年龄人群都可能发生，尤其在亚洲人群中发生率相对较高。
肠道敏感
部分人的肠道较为敏感，空腹状态下，牛奶进入肠道，可能引发肠道的应激反应，导致肠道蠕动加快，出现拉肚子情况。这与个人的肠道功能状态有关，生活方式、既往肠道健康史等都会影响肠道的敏感性，比如长期饮食不规律的人可能更易出现这种情况。
牛奶蛋白过敏
对牛奶蛋白过敏的人，空腹喝牛奶后，免疫系统会将牛奶蛋白识别为过敏原，引发免疫反应，进而出现拉肚子等过敏症状。这种情况在有过敏体质的人群中存在，不同年龄段都可能发生，有家族过敏史的人群风险相对更高。
胃肠功能紊乱
本身胃肠功能紊乱的人，空腹喝牛奶会加重胃肠负担，影响胃肠正常的消化吸收功能，导致肠道功能失调，出现拉肚子现象。这与个人的生活习惯、精神状态等相关，比如长期精神压力大、作息不规律的人胃肠功能易紊乱。