一、肌肉骨骼系统原因
1.腰肌劳损：多因长期不良姿势（如久坐、久站、长期弯腰工作等）导致腰部肌肉、筋膜等软组织慢性损伤。腰部肌肉持续处于紧张状态，引发慢性无菌性炎症，表现为腰部反复的困疼，尤其在劳累后症状加重，休息后可稍有缓解，常见于长期从事重体力劳动或缺乏运动锻炼且姿势不当的男性。
2.腰椎间盘突出：随着年龄增长、椎间盘退变、外伤等因素，椎间盘的纤维环破裂，髓核突出，压迫周围神经组织。除腰部困疼外，还可能伴有下肢放射性疼痛、麻木等症状，常见于中老年人，但如今因不良生活方式影响，青壮年男性也时有发病，长期久坐、腰部负荷过重是诱因之一。
3.腰椎骨质增生：腰椎椎体边缘因长期应力刺激等出现骨质增生，增生的骨质可能刺激周围软组织，引起腰部困疼，一般在活动时症状可能有变化，年龄增长是重要因素，男性随着年龄增加，腰椎退变加速，患腰椎骨质增生导致腰困疼的风险升高。
二、泌尿系统原因
1.肾结石：肾脏内形成结石，结石在肾盂或输尿管内移动时，会刺激肾盂或输尿管黏膜，引起腰部剧烈的困疼，疼痛常较为突然且剧烈，可向会阴部放射，同时可能伴有血尿、尿频、尿急等症状，男性发病率相对较高，与饮水过少、饮食习惯等有关。
2.输尿管结石：输尿管内结石梗阻，导致尿液排出受阻，引起输尿管痉挛，出现腰部困疼，疼痛性质多较尖锐，常伴有恶心、呕吐等症状，和肾结石成因有一定关联，也是男性常见的泌尿系统导致腰困疼的原因。
三、自身免疫性疾病
强直性脊柱炎：多见于青壮年男性，是一种自身免疫性疾病，主要累及脊柱、骶髂关节等部位。早期表现为下腰部慢性困疼、僵硬，晨起时症状较为明显，活动后可稍有缓解，病情逐渐进展可导致脊柱活动受限甚至畸形，有家族遗传倾向的男性需重点关注。